17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4983 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4983  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1093    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4980  hypothetical protein  89.59 
 
 		 685 aa  967    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4967  hypothetical protein  57.21 
 
 		 290 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  44.34 
 
 		 787 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  45.73 
 
 		 787 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  49.28 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  40.8 
 
 		 709 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  34 
 
 		 833 aa  70.1  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  32.6 
 
 		 2336 aa  58.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.22 
 
 		 1236 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2041  response regulator receiver domain-containing protein  35.16 
 
 		 213 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  27.89 
 
 		 1712 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.47 
 
 		 2353 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4100  hypothetical protein  29.21 
 
 		 215 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00402166  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3409  hypothetical protein  37.5 
 
 		 580 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.308455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  32.97 
 
 		 5020 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>