30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4202 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  74.72 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  56.35 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  56.35 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  57.03 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  59.59 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  41.2 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  39.34 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  39.92 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  38.26 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  39.08 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  37.8 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  46.2 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  36.3 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  32.24 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  33.59 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  31.58 
 
 		 208 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  31.86 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  32.14 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  29.26 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  28.3 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  27.03 
 
 		 439 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  34.51 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  28.23 
 
 		 169 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  28.24 
 
 		 205 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  29.46 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>