58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2550 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2550  acid phosphatase  100 
 
 
272 aa  517  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3722  phosphoesterase PA-phosphatase related  73.8 
 
 
273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  58.27 
 
 
295 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  49.62 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  54.67 
 
 
296 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  52.89 
 
 
292 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0256  acid phosphatase  48.72 
 
 
253 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.136313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  45.5 
 
 
279 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  38.15 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.92 
 
 
262 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  43.96 
 
 
265 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  45.25 
 
 
582 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  42.13 
 
 
289 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  40.72 
 
 
283 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  37.95 
 
 
285 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  34.82 
 
 
249 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  38.5 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  32.21 
 
 
253 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  34.29 
 
 
250 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  34.29 
 
 
250 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  34.29 
 
 
250 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  34.29 
 
 
250 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  34.29 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  33.64 
 
 
287 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  31.68 
 
 
248 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.73 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  36 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  33.11 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.16 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  27.87 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.53 
 
 
431 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.77 
 
 
447 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.26 
 
 
472 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  31.69 
 
 
641 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  27.33 
 
 
423 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.78 
 
 
465 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.46 
 
 
470 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  27.33 
 
 
423 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.9 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  27.33 
 
 
423 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.07 
 
 
425 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  28.98 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.21 
 
 
178 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.92 
 
 
510 aa  50.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  38.98 
 
 
1062 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.29 
 
 
187 aa  45.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.29 
 
 
634 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.29 
 
 
634 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.82 
 
 
515 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.86 
 
 
1011 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.62 
 
 
174 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  32.85 
 
 
657 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.01 
 
 
661 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  29.7 
 
 
182 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.44 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.62 
 
 
176 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>