More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0512 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0512  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 333 aa  661    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  78.08 
 
 		 333 aa  531  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0573  rod shape-determining protein MreB  71.47 
 
 		 335 aa  488  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.788232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  66.47 
 
 		 340 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  65.18 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 		 343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  59.16 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  60.78 
 
 		 343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  58.97 
 
 		 346 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.12 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  60.67 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  56.55 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  58.01 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  57.7 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  56.29 
 
 		 345 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  56.84 
 
 		 343 aa  381  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  58.63 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  54.01 
 
 		 347 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  53.12 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  53.41 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.05 
 
 		 350 aa  364  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  54.82 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  53.12 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  53.12 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  54.22 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  51.67 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 346 aa  362  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  53.27 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  54.57 
 
 		 343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  53.12 
 
 		 346 aa  361  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  54.57 
 
 		 343 aa  361  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  53.41 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  54.22 
 
 		 342 aa  359  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  53.41 
 
 		 346 aa  359  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.93 
 
 		 344 aa  359  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  55.22 
 
 		 342 aa  358  7e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  52.98 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  53.05 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  52.82 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  52.45 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  52.51 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 		 368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  53.82 
 
 		 343 aa  355  5.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  53.35 
 
 		 342 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  52.08 
 
 		 347 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  52.08 
 
 		 347 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  52.68 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.35 
 
 		 337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  52.13 
 
 		 343 aa  350  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3144  rod shape-determining protein Mbl  53.89 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.94 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  52.44 
 
 		 342 aa  349  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.91 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.98 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  51.79 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  51.94 
 
 		 346 aa  346  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  53.99 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4763  rod shape-determining protein Mbl  54.13 
 
 		 328 aa  345  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000280779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0242  rod shape-determining protein MreB  54.71 
 
 		 329 aa  346  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  54.6 
 
 		 353 aa  346  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  51.64 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  51.82 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  52.25 
 
 		 345 aa  345  6e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2769  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.45 
 
 		 348 aa  345  8e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.966477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.13 
 
 		 344 aa  345  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  51.98 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  53.43 
 
 		 347 aa  342  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0510  rod shape-determining protein MreB  52.6 
 
 		 336 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4074  rod shape-determining protein MreB  52.45 
 
 		 333 aa  341  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00041053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1263  rod shape-determining protein MreB  52.29 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  51.63 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1390  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>