More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1390 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1390  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
335 aa  668    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0573  rod shape-determining protein MreB  54.88 
 
 
335 aa  351  8.999999999999999e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.788232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0512  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 
333 aa  341  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 
333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  46.04 
 
 
343 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  46.77 
 
 
340 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  45.15 
 
 
343 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  45.43 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  44.01 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  44.82 
 
 
343 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  43.6 
 
 
347 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  44.51 
 
 
338 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  44.18 
 
 
340 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  44.85 
 
 
339 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.23 
 
 
344 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  44.79 
 
 
340 aa  275  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  44.79 
 
 
343 aa  275  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  44.21 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  45.09 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  45.34 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  44.27 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  43.96 
 
 
344 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  45.29 
 
 
338 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  43.96 
 
 
344 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  45.43 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  43.96 
 
 
344 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  43.65 
 
 
344 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.03 
 
 
350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  43.65 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  42.68 
 
 
347 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  43.34 
 
 
344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  42.04 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  45.48 
 
 
343 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  42.38 
 
 
348 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  42.07 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  42.38 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  42.38 
 
 
347 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  43.69 
 
 
343 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  42.38 
 
 
347 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.86 
 
 
344 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  43.69 
 
 
343 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  44.01 
 
 
342 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  42.07 
 
 
347 aa  262  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  43.9 
 
 
358 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.38 
 
 
344 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  42.77 
 
 
340 aa  261  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  43.71 
 
 
342 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  43.29 
 
 
358 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.15 
 
 
339 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  44.04 
 
 
342 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  43.29 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  44.38 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  41.9 
 
 
344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  43.03 
 
 
345 aa  258  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  41.23 
 
 
345 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  41.25 
 
 
346 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  42.07 
 
 
345 aa  258  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  42.81 
 
 
342 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  40.6 
 
 
345 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  46.13 
 
 
336 aa  257  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  46.13 
 
 
336 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  43.83 
 
 
368 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  44.24 
 
 
346 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  42.95 
 
 
345 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2769  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.15 
 
 
348 aa  256  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.966477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  43.03 
 
 
342 aa  256  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  42.07 
 
 
347 aa  255  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  40.85 
 
 
346 aa  255  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  43.5 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  41.95 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  41.46 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  43.73 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  41.05 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  43.3 
 
 
343 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  44.14 
 
 
345 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  41.02 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.34 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  43.08 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  42.77 
 
 
349 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  41.46 
 
 
346 aa  252  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  41.62 
 
 
346 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  42.81 
 
 
351 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  43.03 
 
 
335 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  41.9 
 
 
346 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  41.05 
 
 
343 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  40.67 
 
 
346 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  41.64 
 
 
346 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  40.96 
 
 
346 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.95 
 
 
336 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  40.49 
 
 
342 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  41.21 
 
 
346 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>