More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1061 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 		 484 aa  969    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  100 
 
 		 483 aa  967    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  58.32 
 
 		 499 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  54.47 
 
 		 490 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  50.63 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  49.06 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  50.73 
 
 		 469 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.38 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  46.47 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.29 
 
 		 517 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.32 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.4 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.78 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.69 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  45.91 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  43.04 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  43.04 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  43.04 
 
 		 477 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.88 
 
 		 475 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  43.04 
 
 		 477 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  42.83 
 
 		 477 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  40.93 
 
 		 472 aa  346  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.82 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.95 
 
 		 499 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.41 
 
 		 1553 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  40.59 
 
 		 478 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  41.92 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.21 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  45.15 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  46.3 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  27.09 
 
 		 449 aa  123  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  28.02 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.31 
 
 		 430 aa  107  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  25.3 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  30.04 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  27.51 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  26.36 
 
 		 444 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.38 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  29.98 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  26.16 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  26.95 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  24.3 
 
 		 449 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  28.37 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.15 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  27.58 
 
 		 451 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  28.63 
 
 		 443 aa  96.7  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  24.3 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  28.23 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  24.49 
 
 		 458 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  28.34 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  29.02 
 
 		 444 aa  95.1  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  27.18 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  28.72 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  28.26 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  29.24 
 
 		 450 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1006  phosphoglucosamine mutase  25.8 
 
 		 455 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  27.68 
 
 		 452 aa  94  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  28.6 
 
 		 444 aa  94  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  27.49 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  27.8 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  28.86 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  28.02 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  27.86 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2223  phosphoglucosamine mutase  28.87 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  27.25 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  28.94 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  26.69 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  26.75 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 452 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1359  phosphoglucosamine mutase  25.8 
 
 		 455 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  26.98 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  27.96 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  27.25 
 
 		 466 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  28.61 
 
 		 496 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  28.61 
 
 		 496 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  27.42 
 
 		 450 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  25.9 
 
 		 450 aa  90.9  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  26.55 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  29.26 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  26.29 
 
 		 450 aa  90.5  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  26.86 
 
 		 447 aa  90.1  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  26.34 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.29 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1270  phosphoglucosamine mutase  27.54 
 
 		 451 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0818  phosphoglucosamine mutase  27.54 
 
 		 451 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1299  phosphoglucosamine mutase  27.54 
 
 		 451 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  29.9 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  27.2 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  27.2 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  25.22 
 
 		 444 aa  89  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  24.7 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2815  phosphoglucosamine mutase  27.25 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  24.7 
 
 		 452 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  26.25 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>