16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0279 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0279  conjugal transfer protein TraB  100 
 
 		 452 aa  895    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1421  conjugal transfer protein TraB  89.91 
 
 		 436 aa  746    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1731  conjugal transfer protein TraB  87.06 
 
 		 446 aa  725    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4542  conjugal transfer protein TraB  32.23 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7066  conjugal transfer protein TraB  29.92 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1610  TraB family protein  29.82 
 
 		 397 aa  117  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9192  conjugal transfer protein TraB  28.19 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9597  conjugal transfer protein TraB  28.68 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5512  conjugal transfer protein TraB  27.46 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569309  normal  0.0492499 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5391  conjugal transfer protein TraB  29.55 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970188  normal  0.166771 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5005  conjugal transfer protein TraB  26.42 
 
 		 417 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441858  normal  0.356102 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5410  conjugal transfer protein TraB  26.42 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2806  TraB family protein  29.9 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5093  conjugal transfer protein TraB  23.11 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.685787 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4489  conjugal transfer protein TraB  22.9 
 
 		 403 aa  57  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5052  conjugal transfer protein TraB  23.08 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>