32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3205 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  64.11 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  60.75 
 
 		 297 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  59.39 
 
 		 261 aa  321  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  61.54 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  59 
 
 		 261 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  61.38 
 
 		 239 aa  316  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  59.23 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  61.67 
 
 		 259 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  66.23 
 
 		 253 aa  311  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  62.11 
 
 		 236 aa  310  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  65.37 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  64.19 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  58.62 
 
 		 269 aa  304  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  61.14 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  61.06 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  58.06 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  56.32 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  63.56 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  56.7 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  63.27 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  59.03 
 
 		 237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  54.92 
 
 		 249 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  54.22 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  54.59 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  54.98 
 
 		 249 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  57.64 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  54.59 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  55.51 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  49.62 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  51.98 
 
 		 261 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  38.03 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>