18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2568 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  316  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  61.73 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  58.08 
 
 		 170 aa  187  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  58.13 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  51.55 
 
 		 189 aa  158  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  56.44 
 
 		 183 aa  158  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  58.16 
 
 		 185 aa  157  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  55.83 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  60.43 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  38.55 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  35.54 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  35.14 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.38 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.65 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.82 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  29.22 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0499  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>