41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2441 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  100 
 
 		 89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  52.81 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  48.31 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  51.69 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  50.56 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  46.07 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  44.94 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  46.07 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  46.07 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  43.82 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  46.07 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  44.94 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  44.94 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  49.44 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  44.94 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  46.07 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  46.07 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  35.29 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  40 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  33.8 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  31.11 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  32.18 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.99 
 
 		 364 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  38.46 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  32.39 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  30 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  35.82 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  30.86 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  29.89 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  34.85 
 
 		 92 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  34.78 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32 
 
 		 480 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  35.38 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  29.58 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0496  molybdopterin converting factor small subunit  29.03 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  38.27 
 
 		 648 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  34.18 
 
 		 98 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>