More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1039 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  71.76 
 
 		 259 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  56.2 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  54.47 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  51.54 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  51.64 
 
 		 249 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  50.81 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  50.81 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  51.81 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  51.81 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  51.81 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  51.81 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  52.89 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  52.72 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  50.21 
 
 		 256 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  50 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  50 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  48.61 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  48.61 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  48.61 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  48.61 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  48.61 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  48.16 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 251 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  47.28 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  50.83 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  50.83 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  48.54 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  48.54 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  48.54 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  44.35 
 
 		 246 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  45.04 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  43.03 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4681  IstB ATP binding domain-containing protein  44.08 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  45.68 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  45.68 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  46.5 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  45.68 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  45.68 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  45.61 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  41.06 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  45.61 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  43.93 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  42.61 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  42.61 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  43.51 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 252 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 252 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 252 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  41.83 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4722  IstB ATP binding domain-containing protein  46.09 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  41.8 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  43.67 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  43.21 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  43.21 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  41.53 
 
 		 247 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2547  IstB-like ATP-binding protein  40.98 
 
 		 247 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.961939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1831  ATPase  39.75 
 
 		 246 aa  178  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00675411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7623  IstB ATP binding domain-containing protein  58.33 
 
 		 194 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.933232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3434  IstB ATP binding domain-containing protein  43.35 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1428  IstB ATP binding domain-containing protein  38.17 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1483  IstB ATP binding domain-containing protein  38.17 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1926  IstB ATP binding domain-containing protein  38.17 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2240  IstB ATP binding domain-containing protein  38.17 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6804  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0641169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4303  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4233  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5320  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6164  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4852  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.552048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6979  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5581  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6472  IstB domain protein ATP-binding protein  41 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3015  IstB ATP binding domain-containing protein  37.17 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3123  IstB ATP binding domain-containing protein  37.17 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.325822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>