266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0311 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0311  glutaredoxin  100 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4060  glutaredoxin  55.28 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0010  glutaredoxin  60.83 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4338  hypothetical protein  49.56 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2225  monothiol glutaredoxin  34.62 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5638  predicted protein  36.73 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85631  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  33.33 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04720  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.81945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  32.04 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2134  glutaredoxin-like protein  33.65 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.681937  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  33.33 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  35.05 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  32.04 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  30.69 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  28.71 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  27.45 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  28.71 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  30.61 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  29.13 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  28.97 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  28.97 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09521  glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  25.83 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  31.4 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  27.88 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  28.42 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  28.42 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05590  thioredoxin, putative  34.34 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  35.11 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  38.3 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  30.3 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  27.19 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  27.19 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  31.33 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  28.28 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  29.47 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0701  glutaredoxin-like protein  25.71 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.244741  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1122  glutaredoxin-like protein  30.21 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  30.68 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  26.8 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27972  predicted protein  27.64 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48859  predicted protein  27.52 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.815373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  31.07 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  26.47 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  27.62 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  31.07 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12171  glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  28.28 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12181  glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  38.67 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12021  glutaredoxin-like protein  28.72 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  28.74 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  26.53 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0012  glutaredoxin-like protein  26.67 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1374  glutaredoxin-like protein  31.96 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0013  glutaredoxin-like protein  26.67 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  26.8 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0014  glutaredoxin-like protein  26.67 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.900956 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0865  glutaredoxin-like protein  24.18 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353884  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39133  glutaredoxin  24.43 
 
 		 200 aa  50.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  39.08 
 
 		 395 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  26.26 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  26.53 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  27 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  34 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  38.83 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  28.85 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  24.77 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  24.77 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  30.56 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  27.1 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  29.13 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  29.81 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  29.47 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  31.33 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2171  glutaredoxin-like protein  27.72 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1610  glutaredoxin-like protein  35.11 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  29.81 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  25.45 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  28.09 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  31.73 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  28.16 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0187  glutaredoxin-like protein  28.28 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381703  normal  0.468757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  29.89 
 
 		 308 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  31.03 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  29.03 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  29.89 
 
 		 308 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1418  glutaredoxin-like protein  26.73 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1661  glutaredoxin-like protein  28.42 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.147009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  26.97 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  31.73 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  31.73 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1021  glutaredoxin-like protein  28.42 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681267  normal  0.445361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  29.91 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.045295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>