237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0010 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0010  glutaredoxin  100 
 
 
121 aa  247  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4060  glutaredoxin  71.07 
 
 
127 aa  180  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0311  glutaredoxin  60.83 
 
 
126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4338  hypothetical protein  48.31 
 
 
125 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  35.64 
 
 
110 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  28.7 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2225  monothiol glutaredoxin  30.69 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  32.71 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04720  conserved hypothetical protein  36.11 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.81945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  29.73 
 
 
308 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  31.68 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  35.62 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  30.21 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  30.93 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  28.42 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2134  glutaredoxin-like protein  29.7 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.681937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  30.09 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  30.19 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  27.72 
 
 
308 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  36.46 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  34 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  34.25 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  29.7 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 
308 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 
308 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  29.29 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  29.59 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  29.59 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  29.29 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  29.29 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  29.29 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  29.29 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  29.29 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  29.29 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1760  glutaredoxin-like protein  32.76 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.608629  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  29.29 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  29.29 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  29.29 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  29.29 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1796  glutaredoxin-like protein  34.58 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  31.73 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  29.29 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  29.29 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  30.93 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3704  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473777  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  30.93 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  29.9 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  34.78 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0187  glutaredoxin-like protein  30 
 
 
111 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381703  normal  0.468757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
108 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  27.55 
 
 
110 aa  52  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  30.84 
 
 
103 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 
105 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09521  glutaredoxin-like protein  30.21 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05590  thioredoxin, putative  34.65 
 
 
242 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32051  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  29.9 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  31.82 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  31.68 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  31.68 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  27.37 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  27.96 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  29.29 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  30.19 
 
 
110 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1661  glutaredoxin-like protein  32.29 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.147009  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  30.3 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5638  predicted protein  36.23 
 
 
304 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85631  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48859  predicted protein  29.17 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.815373  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  27.96 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  26.32 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1610  glutaredoxin-like protein  29.03 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  29.29 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  29.29 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  28.87 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  30.34 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1374  glutaredoxin-like protein  29 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1418  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  30.39 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  27.96 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  26.04 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  25.26 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  29.29 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  29.29 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  31 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  29.29 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  27.08 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>