296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2078 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  100 
 
 
110 aa  229  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  59.22 
 
 
108 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  59.22 
 
 
108 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  59.81 
 
 
108 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  58.25 
 
 
108 aa  140  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  59.6 
 
 
111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  57.55 
 
 
106 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  57.94 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  58.59 
 
 
111 aa  136  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  59.6 
 
 
152 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  54.29 
 
 
115 aa  135  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  54.29 
 
 
115 aa  135  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  59.6 
 
 
99 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  62.14 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  58.59 
 
 
99 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  54.21 
 
 
112 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  61.46 
 
 
110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  57.58 
 
 
111 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  62.14 
 
 
103 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  59.26 
 
 
109 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  57.58 
 
 
113 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  58.82 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 
103 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  55.24 
 
 
108 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  53.33 
 
 
111 aa  133  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  58.82 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  58.82 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  58.82 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  58.82 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  58.82 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  58.82 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  58.82 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  63 
 
 
110 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  55.24 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1242  glutaredoxin-related protein  52.38 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.828915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1150  glutaredoxin-like protein  52.38 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 
103 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 
103 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  55.56 
 
 
116 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  55.56 
 
 
116 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 
103 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  52.29 
 
 
114 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  55.56 
 
 
116 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  48.18 
 
 
110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 
103 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  56 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  50 
 
 
110 aa  130  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  53.7 
 
 
109 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.508433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  53.61 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  59.22 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  51.52 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  58.33 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  55.67 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  51 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  54.64 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 
106 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  47.27 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  59.18 
 
 
103 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2160  glutaredoxin-like protein  50.51 
 
 
116 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.277546  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 
110 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000581694  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 
110 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000259728  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 
110 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000432966  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  55.14 
 
 
109 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  55.14 
 
 
109 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  56.86 
 
 
107 aa  126  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2670  hypothetical protein  53.61 
 
 
116 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0262215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  55 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  52.83 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  47.57 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000151147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  47.57 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000936402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  47.12 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  59.18 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  47.57 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000230073  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  51.92 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  44.55 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  47.71 
 
 
116 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2444  glutaredoxin-like protein  49.49 
 
 
115 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72039  normal  0.0565869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2386  hypothetical protein  52.58 
 
 
116 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  51.4 
 
 
112 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0491  glutaredoxin-related protein  55.56 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2880  glutaredoxin domain-containing protein  47.12 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>