More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3038 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 110 aa  223  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  100 
 
 		 110 aa  223  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  69.61 
 
 		 106 aa  161  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  70.59 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  61.39 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  58.49 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  61 
 
 		 106 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  64.89 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  61.46 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  61 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  58 
 
 		 103 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  58.59 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  58.59 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  58.59 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  58.59 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  58.59 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  58.59 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  58.59 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  57 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  58.59 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  56 
 
 		 103 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  58 
 
 		 103 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  58 
 
 		 103 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  56.86 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  54.29 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  57 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  56.44 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  54.29 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  54.81 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  57.8 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  57 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  55.34 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  57 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  56.19 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  57 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  56.73 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  56 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  55.34 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  56.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  53.21 
 
 		 109 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  53.21 
 
 		 109 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  52.83 
 
 		 109 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  52.73 
 
 		 110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  60.58 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  55.56 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  58.16 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  53.47 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  51.49 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  52.94 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  53.92 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  52.94 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  52.94 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  54.72 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  55.56 
 
 		 111 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  56.57 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  54.08 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  53.06 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  51.43 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  54.63 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  54.81 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  54.81 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  54.46 
 
 		 110 aa  120  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  52.83 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  51.89 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  52.83 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  52.83 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  51.92 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  55.1 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3704  glutaredoxin-like protein  50.47 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  53.47 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  49.09 
 
 		 111 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  55.1 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  55.77 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  54.9 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  55.1 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  55 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  54.64 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1796  glutaredoxin-like protein  50.47 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  50.48 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  49.07 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>