252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01315 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  100 
 
 
106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1374  glutaredoxin-like protein  79.05 
 
 
106 aa  177  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2225  monothiol glutaredoxin  77.67 
 
 
104 aa  173  8e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2134  glutaredoxin-like protein  76.7 
 
 
104 aa  170  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.681937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  60.58 
 
 
109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 
109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  62.75 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 
112 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  50.5 
 
 
112 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  52.48 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  52.48 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  52.48 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  52.48 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  52.48 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  52.48 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  52.48 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
114 aa  126  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  51.46 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  51.46 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  48.51 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  54.37 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
106 aa  124  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  50.49 
 
 
103 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  51.46 
 
 
110 aa  124  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  50.49 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  50.49 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  55.67 
 
 
103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  49 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  47.57 
 
 
116 aa  124  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  47.57 
 
 
116 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  47.57 
 
 
116 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  50.49 
 
 
103 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  51.49 
 
 
110 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  51.49 
 
 
110 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  50.49 
 
 
103 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  47.52 
 
 
115 aa  123  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
103 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  48.54 
 
 
110 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  53.61 
 
 
103 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2670  hypothetical protein  47.52 
 
 
116 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0262215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2386  hypothetical protein  49.5 
 
 
116 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 
109 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  48.54 
 
 
116 aa  121  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  48.54 
 
 
116 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
129 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  47.52 
 
 
116 aa  120  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  52.08 
 
 
103 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  48.04 
 
 
108 aa  120  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  48.04 
 
 
111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  45 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  52 
 
 
102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
115 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  47.06 
 
 
111 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1919  glutaredoxin-related protein  46.08 
 
 
110 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00265167  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  51.52 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3475  glutaredoxin,-like protein  47 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1859  putative glutaredoxin  48.57 
 
 
111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2449  glutaredoxin-like protein  47.57 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182264  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  51.43 
 
 
110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  45.54 
 
 
110 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296306  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
102 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  47.57 
 
 
108 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  51.55 
 
 
109 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  51.55 
 
 
112 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1640  glutaredoxin-like protein  45.54 
 
 
111 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000518322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  52.08 
 
 
111 aa  116  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  49 
 
 
152 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  45.54 
 
 
113 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  43.69 
 
 
110 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  44.66 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  49.49 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  47.06 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  44.66 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  44.66 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000936402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  47 
 
 
111 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  44.55 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000259728  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  44.55 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000432966  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  44.55 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000581694  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  44.66 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000230073  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  44.66 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000151147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>