More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1131 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1131  IS30 family transposase  100 
 
 
341 aa  711    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0307  IS30 family transposase  33.02 
 
 
309 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0356  IS30 family transposase  32.92 
 
 
309 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1811  IS30 family transposase  32.92 
 
 
309 aa  176  5e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  32.77 
 
 
347 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  32.77 
 
 
347 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  32.77 
 
 
347 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1051  IS30 family transposase  32.43 
 
 
393 aa  145  9e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.722077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  31.21 
 
 
317 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  30.97 
 
 
335 aa  139  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  30.97 
 
 
335 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  30.97 
 
 
335 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  30.97 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  29.63 
 
 
305 aa  137  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  32 
 
 
356 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  30.68 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  29.59 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  29.63 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  30.36 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  32.76 
 
 
383 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  30.56 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  32.47 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  32.47 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  29.48 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  32.47 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  32.47 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  32.47 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  30.36 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  30.36 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  30.36 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  32.47 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  29.7 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  29.7 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  29.7 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  29.7 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  29.7 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  29.7 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  29.7 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  29.7 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  29.7 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  28.48 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4885  integrase catalytic region  30.14 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  30.14 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1287  integrase catalytic region  30.14 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  32.35 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  30.36 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  29.64 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  30.36 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  30.36 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  30.36 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  30.36 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
313 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
313 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
313 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
313 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
313 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  33.85 
 
 
290 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  33.85 
 
 
290 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  28.18 
 
 
315 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  28.18 
 
 
315 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  28.18 
 
 
315 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  33.85 
 
 
290 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>