34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0500 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0500  sugar phosphate isomerase/epimerase  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0428613  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1669  sugar phosphate isomerase/epimerase  37.12 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000240726  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0128  sugar phosphate isomerase/epimerase  37.92 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334205  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  35.96 
 
 		 271 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0060  xylose isomerase domain-containing protein  31.09 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3415  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.9 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3379  xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.22 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1802  hypothetical protein  30.17 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2379  xylose isomerase domain-containing protein  34.38 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26880  hypothetical protein  32.44 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0781566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2565  xylose isomerase domain-containing protein  32.14 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743333  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2901  xylose isomerase-like TIM barrel  32.75 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0170  xylose isomerase domain-containing protein  31.43 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35360  hypothetical protein  31.55 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101497  normal  0.0806512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2568  xylose isomerase domain-containing protein  30.22 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2980  hypothetical protein  31.5 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0755  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.36 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  26.64 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.83 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1655  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1734  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6345  xylose isomerase-like TIM barrel  26.67 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1655  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.71258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1747  xylose isomerase domain-containing protein  25.83 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2295  hypothetical protein  27.78 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1525  xylose isomerase domain-containing protein  30.07 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394526  normal  0.900622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5030  xylose isomerase-like TIM barrel  28.28 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0960  hypothetical protein  26.62 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2289  AP endonuclease  26.62 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2155  hypothetical protein  26.62 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1979  putative epimerase, KguE-like  23.08 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0445694 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2097  hypothetical protein  25.9 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.89 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3065  xylose isomerase-like  30.26 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>