More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t0753 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t0753  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0540995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  98.63 
 
 		 74 bp  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  97.26 
 
 		 74 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  95.89 
 
 		 74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  95.89 
 
 		 74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  95.89 
 
 		 74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  96.83 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  93.15 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  94.52 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  94.52 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  94.52 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  94.52 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  94.52 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3126t  tRNA-Met  95.16 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.355044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.390156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  93.15 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0045  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  95.38 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  95.38 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0081  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.681899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0054  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.965262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0068  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.347514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0076  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00786304  normal  0.218816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0007  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  93.15 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0052  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.902877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0056  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.880459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0055  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0054  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.871356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0053  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0057  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.88568 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  92.96 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>