258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2063 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2063  adenosine deaminase  100 
 
 
351 aa  700    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  41.55 
 
 
343 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2520  adenosine deaminase  35.64 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  34.5 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4621  adenosine deaminase  34.74 
 
 
366 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  33.33 
 
 
355 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0389  adenosine deaminase  34.74 
 
 
366 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.95283  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5013  adenosine deaminase  34.74 
 
 
366 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0987711  normal  0.802668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1681  adenosine deaminase  35.96 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3107  adenosine deaminase  34.14 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.323824  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5260  adenosine deaminase  34.14 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402551  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5147  adenosine deaminase  34.44 
 
 
366 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  31.04 
 
 
335 aa  172  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  34.04 
 
 
343 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  32.02 
 
 
365 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  32.08 
 
 
375 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  32.46 
 
 
349 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  30.95 
 
 
337 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  33.33 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  33.33 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  32.93 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  33.54 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  31.1 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  32.13 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  32.13 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  32.84 
 
 
339 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  31.25 
 
 
315 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  30.91 
 
 
346 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  31.96 
 
 
315 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  29.53 
 
 
336 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  31.11 
 
 
317 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  32.06 
 
 
315 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  31.75 
 
 
316 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  35.26 
 
 
346 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  33.94 
 
 
341 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  30.21 
 
 
335 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  31.43 
 
 
317 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  30 
 
 
343 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  31.87 
 
 
345 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  31.43 
 
 
316 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  31.43 
 
 
315 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  34.84 
 
 
353 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  31.43 
 
 
318 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  31.93 
 
 
354 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  30.65 
 
 
338 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  32.33 
 
 
329 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  32.62 
 
 
361 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  31.58 
 
 
345 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  31.87 
 
 
345 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  31.43 
 
 
315 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  29.94 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  30.09 
 
 
360 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  31.67 
 
 
345 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  33.52 
 
 
346 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  32.27 
 
 
366 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  31.93 
 
 
343 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  31.55 
 
 
350 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  30.79 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  30.56 
 
 
341 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  31.02 
 
 
351 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  30.09 
 
 
356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  27.73 
 
 
332 aa  152  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  26.51 
 
 
330 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  28.49 
 
 
338 aa  152  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  29.34 
 
 
326 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  32.63 
 
 
339 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  32.14 
 
 
341 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  32.74 
 
 
341 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  30.64 
 
 
354 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  32.12 
 
 
353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  31.85 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  28.78 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  31.09 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  31.85 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  28.61 
 
 
336 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  31.09 
 
 
350 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  31.85 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  31.85 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  31.85 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  31.85 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  29.04 
 
 
326 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  30.27 
 
 
346 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  27.62 
 
 
338 aa  146  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  29.85 
 
 
341 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  31.82 
 
 
334 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  31.21 
 
 
342 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  29.52 
 
 
344 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  28.31 
 
 
335 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  30.21 
 
 
337 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  26.28 
 
 
328 aa  142  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  28.01 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  30.63 
 
 
333 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  30.46 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  26.51 
 
 
346 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  30.29 
 
 
342 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  30.51 
 
 
341 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  30.46 
 
 
341 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  32.12 
 
 
328 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  30.06 
 
 
341 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  30.38 
 
 
341 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>