16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0186 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  786    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  36.98 
 
 		 545 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  31.73 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  33.2 
 
 		 266 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1278 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  31.25 
 
 		 523 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  33.21 
 
 		 710 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  32.9 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3665  hypothetical protein  52.56 
 
 		 104 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  32.26 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  28.09 
 
 		 755 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  27.76 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4479  hypothetical protein  28.27 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.87 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.51 
 
 		 303 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>