More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1837 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.87 
 
 
485 aa  686    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.58 
 
 
490 aa  673    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  72.11 
 
 
475 aa  702    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.04 
 
 
486 aa  663    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  69.14 
 
 
475 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.73 
 
 
478 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  70.45 
 
 
476 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.62 
 
 
519 aa  686    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  74.3 
 
 
506 aa  765    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  67.97 
 
 
485 aa  676    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.78 
 
 
487 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  70.87 
 
 
484 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.91 
 
 
489 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.58 
 
 
491 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.63 
 
 
478 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  79.72 
 
 
498 aa  807    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  67.97 
 
 
483 aa  671    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
494 aa  1018    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.18 
 
 
498 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73 
 
 
512 aa  737    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.01 
 
 
478 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.9 
 
 
485 aa  692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.77 
 
 
495 aa  634    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.78 
 
 
492 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  66.6 
 
 
488 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.78 
 
 
496 aa  696    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.49 
 
 
476 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.58 
 
 
492 aa  709    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  67.41 
 
 
495 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.42 
 
 
476 aa  678    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.7 
 
 
496 aa  692    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.12 
 
 
485 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  72.52 
 
 
478 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  65.5 
 
 
489 aa  634  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.7 
 
 
489 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.77 
 
 
486 aa  631  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.7 
 
 
489 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.73 
 
 
491 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.73 
 
 
491 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.73 
 
 
491 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.73 
 
 
493 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.36 
 
 
471 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.93 
 
 
472 aa  585  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.97 
 
 
480 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.26 
 
 
480 aa  586  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.16 
 
 
471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  58.82 
 
 
481 aa  582  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.78 
 
 
471 aa  579  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.36 
 
 
471 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.32 
 
 
472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.44 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
476 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.21 
 
 
473 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.76 
 
 
471 aa  566  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.79 
 
 
477 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.97 
 
 
472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.7 
 
 
481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.98 
 
 
464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.12 
 
 
479 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
476 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61 
 
 
476 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.41 
 
 
476 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.71 
 
 
472 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.71 
 
 
464 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.54 
 
 
471 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.02 
 
 
463 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.19 
 
 
466 aa  558  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.88 
 
 
477 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.6 
 
 
463 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.97 
 
 
479 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.6 
 
 
463 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.12 
 
 
477 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.44 
 
 
473 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  59 
 
 
512 aa  555  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.27 
 
 
463 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.87 
 
 
474 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.88 
 
 
477 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.32 
 
 
462 aa  551  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.51 
 
 
472 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.47 
 
 
474 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.04 
 
 
476 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.08 
 
 
479 aa  554  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.26 
 
 
480 aa  551  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.44 
 
 
509 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
471 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.47 
 
 
474 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.08 
 
 
470 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.88 
 
 
469 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.71 
 
 
465 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.7 
 
 
485 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.25 
 
 
476 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.88 
 
 
467 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.55 
 
 
481 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  58.01 
 
 
470 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.61 
 
 
473 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.76 
 
 
472 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34856  predicted protein  58.4 
 
 
482 aa  549  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0352845  normal  0.14171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
471 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.78 
 
 
466 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.26 
 
 
470 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>