62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0153 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0153  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  205  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3980  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.1 
 
 
279 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1765  Protein of unknown function DUF2249  57.3 
 
 
104 aa  95.9  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.552267  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23290  hypothetical protein  52.38 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1637  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.613783  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3486  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.7 
 
 
254 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  45.71 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  45.71 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  45.71 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  45.71 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  45.71 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  45.71 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  43.66 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  43.48 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  42.03 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  42.03 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  44.44 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  43.42 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  43.42 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  37.88 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2348  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  34.57 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  44.29 
 
 
78 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  35.71 
 
 
240 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.71 
 
 
240 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.71 
 
 
240 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  37.31 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  37.14 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  37.68 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2175  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  hitchhiker  0.00000399577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2384  hypothetical protein  40.85 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1236  hypothetical protein  37.68 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000489654  unclonable  0.0000000165083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  37.68 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  34.29 
 
 
204 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  35.71 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  34.85 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  39.13 
 
 
82 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  32.86 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  32.86 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  37.68 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  32.58 
 
 
354 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  37.68 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2509  hypothetical protein  37.14 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.646613  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2292  hypothetical protein  39.44 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0146361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4723  hypothetical protein  37.31 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2518  hypothetical protein  35.82 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1329  hypothetical protein  34.29 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.266381  normal  0.659886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4145  hypothetical protein  35.71 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.441445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  37.68 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1269  hypothetical protein  33.8 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  31.88 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1607  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1524  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0104  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03037  hypothetical protein  27.14 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374942  normal  0.0219122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  30 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>