249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0032 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144022  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0198  tRNA-Thr  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0038  tRNA-Thr  96.55 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70785  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4335  tRNA-Thr  96.55 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0007  tRNA-Thr  96.55 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0044  tRNA-Thr  92.75 
 
 
75 bp  97.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000154669  normal  0.0727135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  96.43 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  96.43 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  96.43 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0061  tRNA-Thr  96.23 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296073  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0047  tRNA-Thr  96.23 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000841137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0039  tRNA-Thr  96.23 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.103551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0034  tRNA-Thr  96.23 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.952764  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0025  tRNA-Thr  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0021  tRNA-Thr  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  normal  0.107554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0075  tRNA-Thr  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.648131  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0078  tRNA-Thr  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0001  tRNA-Thr  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  94.55 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  94.55 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  94.55 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0052  tRNA-Thr  94.55 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0070  tRNA-Thr  93.1 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0632642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0008  tRNA-Thr  94.44 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6021  tRNA-Thr  93.1 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.893316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  92.86 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0057  tRNA-Thr  92.86 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  92.86 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0072  tRNA-Thr  92.86 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.465958  hitchhiker  0.00803701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0008  tRNA-Thr  97.67 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000961846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0021  tRNA-Thr  92.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0625627  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  97.78 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0005  tRNA-Thr  88.41 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0026  tRNA-Thr  97.73 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000120513  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0105  tRNA-Thr  94.23 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288138  hitchhiker  0.0000019759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0004  tRNA-Thr  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4557  tRNA-Thr  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0007  tRNA-Thr  90.91 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.237633  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0005    90.91 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0020  tRNA-Thr  90.91 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  97.67 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  97.62 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0054  tRNA-Thr  95.24 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0055  tRNA-Thr  95.24 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0355  tRNA-Thr  95.24 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.337369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  97.62 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  97.62 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000937466  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t008  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t004  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811739  normal  0.123776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  97.56 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0124  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000257752  normal  0.024275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000756567  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294168  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0008  tRNA-Thr  92.45 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0130  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000480729  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0070  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000211747  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0014  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116743  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_003295  RS05587  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000149657  normal  0.0701364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000416702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0012  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.11185e-23  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0071  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0072869  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0056  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0111608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0069  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00993164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3795  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0009  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0005  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0048  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.623542  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3085  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000338041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3763  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0051  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1905  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0077  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000188112  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0057  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3460  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000610299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0059  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0057  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145876  hitchhiker  0.000000719754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0014  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000427945  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0014  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000027785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0013  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000441208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0011  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0115711 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3187  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000488058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>