42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0178 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  70 
 
 		 512 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  71.01 
 
 		 528 aa  739    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  73.17 
 
 		 508 aa  700    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  72.26 
 
 		 516 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  72.44 
 
 		 509 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  74.42 
 
 		 508 aa  708    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  81.31 
 
 		 534 aa  863    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  69.35 
 
 		 513 aa  695    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  75.65 
 
 		 508 aa  707    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  78.87 
 
 		 500 aa  763    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  79.64 
 
 		 502 aa  790    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  71.01 
 
 		 533 aa  728    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  79.64 
 
 		 502 aa  791    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  73.67 
 
 		 468 aa  673    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 521 aa  1060    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  72.91 
 
 		 535 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  70.27 
 
 		 540 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  70.97 
 
 		 455 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  37.92 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  40 
 
 		 438 aa  262  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  33.82 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  35.02 
 
 		 412 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  33.01 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  37.59 
 
 		 422 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  34.54 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  34.62 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  33.66 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  32.28 
 
 		 415 aa  243  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.23 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.29 
 
 		 465 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.07 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.07 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.15 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.51 
 
 		 466 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.51 
 
 		 466 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.32 
 
 		 466 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.03 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.62 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.85 
 
 		 422 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.01 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.7 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.32 
 
 		 415 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>