69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1806 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  100 
 
 
241 aa  485  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  68.6 
 
 
246 aa  358  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  43.51 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  40.34 
 
 
494 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  38.66 
 
 
504 aa  184  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  31.22 
 
 
240 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  31.22 
 
 
240 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  30.26 
 
 
253 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  29.82 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  32.11 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  33.78 
 
 
241 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  31.48 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  29.95 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  29.95 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  26.79 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  23.08 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  25.55 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  25.12 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  24.42 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  24.65 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  26.75 
 
 
330 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  24.53 
 
 
548 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.08 
 
 
331 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  25.47 
 
 
325 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  19.28 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  23.21 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  25.35 
 
 
325 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  22.32 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  25.23 
 
 
328 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.64 
 
 
325 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  24.67 
 
 
529 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  22.62 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  24.21 
 
 
332 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  23.28 
 
 
324 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  24.41 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  23.61 
 
 
329 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  21.49 
 
 
336 aa  52.4  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.54 
 
 
349 aa  52.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3187  Glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.65 
 
 
284 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00709898  hitchhiker  0.0000413631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  22.27 
 
 
326 aa  52  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1959  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  24.48 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0146821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  24.24 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1132  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.25 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  23.2 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1250  nucleotidyl transferase  22.51 
 
 
257 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.396561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  22.93 
 
 
336 aa  48.9  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0569  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  21.61 
 
 
274 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.706557  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  27.32 
 
 
411 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0591  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  21.69 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.157461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3930  nucleotidyl transferase  20.6 
 
 
284 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0216  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.22 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.800339  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.04 
 
 
333 aa  45.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2148  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  22.22 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111552  hitchhiker  0.000564894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3402  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  21.65 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000563603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2657  nucleotidyl transferase  22.71 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  22 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  21.72 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  23.79 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  24.06 
 
 
411 aa  43.9  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  21.63 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0800  nucleotidyl transferase  18.78 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  28.11 
 
 
411 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1908  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  21.5 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.83 
 
 
354 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0211  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.65 
 
 
461 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727412 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0877  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.12 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  22.94 
 
 
338 aa  42  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>