29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1637 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  100 
 
 		 145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  93.2  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  39.01 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  37.14 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  38.57 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  38.57 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  38.57 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  38.57 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  39.01 
 
 		 143 aa  83.6  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  31.51 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.56 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.25 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  29.45 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  29.79 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  29.25 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  32.65 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  28.67 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  30 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  37.17 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  29.53 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  29.25 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  27.89 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.62 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3910  hypothetical protein  29.66 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.883796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  27.89 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  27.7 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  25.83 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>