20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2974 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2974  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598698  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2571  hypothetical protein  53.17 
 
 
208 aa  222  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.35222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0610  hypothetical protein  47.42 
 
 
215 aa  191  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0633  hypothetical protein  43.63 
 
 
221 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2097  hypothetical protein  41.06 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1992  hypothetical protein  30.1 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.770462  normal  0.123925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1578  Uracil-DNA glycosylase-like protein  31.58 
 
 
220 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3342  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.58 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.08 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26.5 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3700  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  22.8 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.29 
 
 
193 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  23.95 
 
 
192 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.36 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.46 
 
 
226 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.57 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  25 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.48 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.93 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.07 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>