295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0019 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0019  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00742294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00351824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0001  tRNA-Asn  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.432405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0025  tRNA-Asn  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00179903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0002  tRNA-Asn  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.823848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0023  tRNA-Asn  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.909867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0055  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0004  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0014  tRNA-Asn  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0058  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0062  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.6212e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0068  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0011  tRNA-Asn  88.06 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000022551  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0011  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000646692  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0567  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0014  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000105704  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0043  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.362716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0067  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0035  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0289438  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0044  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243599  hitchhiker  0.00307567 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0013  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000529068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0035  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.365038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0027  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0017  tRNA-Phe  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0070  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0017  tRNA-Phe  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0010  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.026586  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0056  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0071  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0054  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00592499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0009  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000858246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0011  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00974618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0016  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000166672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0056  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0645  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0009  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.990057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00767918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4531  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t056  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t057  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t059  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t061  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t062  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0033  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000129521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0045  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000121203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0034  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0026  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0046  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000070452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5178  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0038  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000589409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0034  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000104343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0031  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000370273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0033  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0039  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000604757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0049  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000179433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0050  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0051  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000803834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0052  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0053  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0054  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0037  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000625887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0035  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000579305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0032  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000864577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0107  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000698154  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0108  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000827722  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0109  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069936  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0110  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000341458  normal  0.142626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0111  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0056  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000234634  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0031  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000137565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0104  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000434862  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0109  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000013008  normal  0.0178475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0110  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000621633  normal  0.0176654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0079  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0080  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000136157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0081  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0082  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0083  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000154707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0084  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0085  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0086  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000000910147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>