299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0043 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0043  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.362716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0067  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0062  tRNA-Asn  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.6212e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0075  tRNA-Asn  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0056  tRNA-Asn  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.880886  decreased coverage  0.00985409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0067  tRNA-Asn  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0045  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0394104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0068  tRNA-Asn  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R85  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000392711  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0019  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00742294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0021  tRNA-Asn  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00000256576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0034  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0027  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167118  normal  0.501278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0016  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.032389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0034  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  87.01 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0922112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00351824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0048  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5180  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.851962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0075  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0567  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0024  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0028  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4139  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.32664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4150  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0028  tRNA-Asn  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.241758  hitchhiker  0.000295694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0014  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000105704  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0048  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0023  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483776  normal  0.0816799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0006  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0039  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  0.700265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t11  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000006616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t13  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000197803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t36  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.036377  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1734  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1735  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1736  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1737  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1738  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.847044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1739  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.829671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t13  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741896  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0028  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0065  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.448477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R72  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564318  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R83  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115902  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0055  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0057  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000607595  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0039  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.722493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0040  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.710582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0065  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000203658  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0064  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000484105  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0063  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807703  normal  0.539027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0062  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112705  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0084  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0030  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0054  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0055  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000306269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0056  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000278009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0057  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000124727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0058  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000115493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0059  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000128133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23490  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00227157  hitchhiker  0.00614087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60180  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000682049  hitchhiker  0.0000000115444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0025  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.469225  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0032  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0037  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000000657367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0038  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0056  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000735522  normal  0.906339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>