183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_R0055 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_R0055  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0004  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0058  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0010  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.026586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0068  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0922112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0009  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.990057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0009  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000858246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0062  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.6212e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0019  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00742294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0014  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000105704  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000529068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00351824  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0567  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0070  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0071  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  96.88 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0027  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167118  normal  0.501278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0016  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.032389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0034  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0034  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0138  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000048306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t055  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t056  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t057  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t059  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t061  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0139  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0132  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0048  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000292562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0135  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000279455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0134  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000272379  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0047  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000310964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0136  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000452408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0131  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000583182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0137  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0133  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000140941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0130  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000587848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0129  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0049  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000179433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0051  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000803834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0052  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0054  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0107  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000698154  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0108  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000827722  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0109  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069936  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0110  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000341458  normal  0.142626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0111  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0112  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0113  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0107  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00061714  normal  0.366999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0108  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.368852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0109  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0110  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000275049  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0111  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000310231  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0112  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  normal  0.38206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0113  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000217944  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0046  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000070452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0014  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51660  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.69309e-16  hitchhiker  0.000488803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60150  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526914  hitchhiker  0.0000000110611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0054  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00592499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0104  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000434862  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0109  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000013008  normal  0.0178475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0110  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000621633  normal  0.0176654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0082  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0083  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000154707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0086  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000000910147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0045  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000121203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0031  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000370273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0032  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000864577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0034  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000104343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0035  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000579305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0037  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000625887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0038  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000589409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0039  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000604757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0050  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0051  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000189133  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0052  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421031  normal  0.358949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0053  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000170712  normal  0.532775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0054  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000247004  normal  0.542082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0055  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000238115  normal  0.540083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0056  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000234634  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0030  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000178627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0031  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000137565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0032  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000114848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0033  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000129521  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0034  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0035  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000175048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4531  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5178  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847952  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0042  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0043  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>