More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6015 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6015  aminotransferase class-III  100 
 
 
451 aa  892    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0352  aminotransferase class-III  38.63 
 
 
455 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0847  aminotransferase class-III  38.65 
 
 
443 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.380309  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3086  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.81 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1811  aminotransferase class-III  39.47 
 
 
454 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.95 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.16 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.33 
 
 
417 aa  244  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.49 
 
 
427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.73 
 
 
427 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  39.82 
 
 
438 aa  239  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.03 
 
 
427 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.6 
 
 
422 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1246  aminotransferase class-III  46.59 
 
 
427 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100805  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.82 
 
 
429 aa  234  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.86 
 
 
427 aa  233  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.11 
 
 
432 aa  232  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6505  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.97 
 
 
429 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.49 
 
 
424 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11660  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.96 
 
 
429 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.545154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12310  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.16 
 
 
428 aa  231  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0595101  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1458  aminotransferase class-III  41.53 
 
 
426 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  32.82 
 
 
452 aa  230  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2502  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.66 
 
 
425 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2901  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.36 
 
 
430 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0920757  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3303  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.36 
 
 
430 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.18 
 
 
418 aa  227  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.12 
 
 
439 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0218  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.84 
 
 
423 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2628  aminotransferase class-III  45.22 
 
 
436 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.78 
 
 
427 aa  226  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.84 
 
 
437 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.25 
 
 
427 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.81 
 
 
430 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.07 
 
 
428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.78 
 
 
422 aa  223  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2608  aminotransferase class-III  37.61 
 
 
455 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.17 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.71 
 
 
432 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0291  aminotransferase class-III  32.24 
 
 
460 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000819224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.1 
 
 
431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.68 
 
 
429 aa  219  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.89 
 
 
432 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.34 
 
 
434 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.32 
 
 
425 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.53 
 
 
422 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.91 
 
 
429 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3708  putative glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.75 
 
 
463 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4475  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.64 
 
 
428 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.64 
 
 
431 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.87 
 
 
426 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.66 
 
 
428 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.1 
 
 
428 aa  216  8e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2085  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.16 
 
 
435 aa  216  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.25 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.48 
 
 
426 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0113  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.16 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0827  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.2 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.215136  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.25 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.25 
 
 
427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.71 
 
 
427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.33 
 
 
432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.25 
 
 
427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.79 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.68 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1970  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.14 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463267  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.94 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.62 
 
 
426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1608  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.3 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.48 
 
 
430 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.79 
 
 
427 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.27 
 
 
430 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.25 
 
 
427 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35 
 
 
437 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.34 
 
 
446 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.155106  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.1 
 
 
428 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.95 
 
 
426 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.03 
 
 
427 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.79 
 
 
426 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1968  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.1 
 
 
431 aa  211  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.58 
 
 
427 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.52 
 
 
427 aa  210  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0442  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.15 
 
 
434 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.21 
 
 
433 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.63 
 
 
428 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.62 
 
 
428 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.02 
 
 
430 aa  210  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.1 
 
 
427 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4790  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.23 
 
 
434 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.302308  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.98 
 
 
425 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.95 
 
 
434 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.49 
 
 
429 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.14 
 
 
433 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.93 
 
 
434 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0531  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.93 
 
 
434 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1034  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.87 
 
 
444 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0514  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.93 
 
 
434 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0101623 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0438  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.16 
 
 
432 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0447  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34 
 
 
432 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0536  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.16 
 
 
432 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>