22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4804 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
309 aa  578  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  42.86 
 
 
851 aa  178  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  44.26 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  41.41 
 
 
663 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  46.01 
 
 
663 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  47.56 
 
 
420 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  41.06 
 
 
645 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  34.85 
 
 
537 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  39.08 
 
 
2055 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  39.11 
 
 
640 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  36.26 
 
 
644 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  39.5 
 
 
638 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  40.5 
 
 
342 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 
602 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  35.62 
 
 
648 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  47.74 
 
 
315 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  51.54 
 
 
715 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  46.51 
 
 
701 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  48 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  33.03 
 
 
1793 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  67.65 
 
 
744 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1717  Disintegrin  51.11 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0506026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>