18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4132 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4132  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  417  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0158477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  27.66 
 
 		 561 aa  52.4  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 715 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.29 
 
 		 705 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  26.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  23.61 
 
 		 578 aa  48.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  39.73 
 
 		 683 aa  48.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  27.98 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4421  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.89 
 
 		 671 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  25.96 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  27.04 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  31.88 
 
 		 163 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  29.85 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  33.04 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  24.31 
 
 		 230 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  26.39 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  25.87 
 
 		 170 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>