27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3130 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  462  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2674  hypothetical protein  32.12 
 
 		 271 aa  72  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  30.84 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  36.36 
 
 		 335 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  28.49 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  31.58 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  31.18 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  41.56 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  25.64 
 
 		 317 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  25.64 
 
 		 317 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  26.04 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1290  hypothetical membrane spanning protein  26.02 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  30.12 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  27.35 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1351  hypothetical protein  25.2 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  32.97 
 
 		 490 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0207  hypothetical protein  27.78 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  26.67 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4337  hypothetical protein  29.61 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  31.65 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  34.65 
 
 		 336 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  25.93 
 
 		 331 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1848  hypothetical protein  30.56 
 
 		 285 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  34.92 
 
 		 360 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  32.73 
 
 		 390 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>