24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1332 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
315 aa  608  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  48.21 
 
 
537 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  52.02 
 
 
851 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  52.44 
 
 
420 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  45.71 
 
 
663 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  41.84 
 
 
2055 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  44.02 
 
 
378 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  41.14 
 
 
663 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  47.74 
 
 
309 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  44.44 
 
 
602 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  35.97 
 
 
638 aa  95.9  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  36.33 
 
 
640 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  34.47 
 
 
645 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  34.87 
 
 
644 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  36.05 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  54.46 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  33.33 
 
 
648 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  41.82 
 
 
715 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2880  hypothetical protein  39.62 
 
 
992 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0985  hypothetical protein  41.76 
 
 
348 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  35.58 
 
 
701 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5749  hypothetical protein  43.68 
 
 
432 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1717  Disintegrin  62.22 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  31.44 
 
 
1793 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>