24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2931 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2931  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  303  5.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0484753  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2479  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1367  hypothetical protein  61.4 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2791  hypothetical protein  66.67 
 
 
267 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0458  hypothetical protein  47.83 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.78691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1732  PASTA domain containing protein  46.15 
 
 
430 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.186477  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  47.27 
 
 
464 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  32.69 
 
 
530 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2652  hypothetical protein  43.55 
 
 
437 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1567  hypothetical protein  45.45 
 
 
431 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  28.79 
 
 
593 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  38.98 
 
 
354 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  38.1 
 
 
743 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  44 
 
 
464 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  39.68 
 
 
388 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  58.82 
 
 
466 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1577  hypothetical protein  37.25 
 
 
335 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  39.62 
 
 
744 aa  42  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  34.85 
 
 
771 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  38.33 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.68 
 
 
457 aa  41.2  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 
394 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  46.94 
 
 
445 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.36 
 
 
198 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>