34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2686 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  239  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  40.17 
 
 
125 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  39.32 
 
 
125 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  40.71 
 
 
125 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  40.52 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  42.02 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  39.45 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  37.14 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  33.33 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  37.19 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  40.66 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  47.76 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  30.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  33.33 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  34.82 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  41.79 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  32.11 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  29.52 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0464  hypothetical protein  25.77 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000221199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  27.93 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  36.84 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  35 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  29.9 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0556  hypothetical protein  35.06 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  28.12 
 
 
118 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  24.42 
 
 
116 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>