More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0648 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0648  carbonic anhydrase  100 
 
 
229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2131  carbonic anhydrase  57.14 
 
 
247 aa  248  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.575311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0295  carbonic anhydrase  59.73 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0295  carbonic anhydrase  50.71 
 
 
226 aa  193  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000632225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1847  carbonic anhydrase  46.69 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0389463  normal  0.137293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0412  Carbonate dehydratase  33.16 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1138  Carbonate dehydratase  28.95 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.580584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0070  carbonate dehydratase  31.61 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  31.28 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  29.69 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2452  carbonic anhydrase-like protein  28.64 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  34.88 
 
 
256 aa  72  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3303  carbonic anhydrase  39.52 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.015811  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  30.81 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  28.99 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  31.11 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  29.41 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  33 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  30.99 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  30.99 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  29.76 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  29.47 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  29.81 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4248  carbonic anhydrase  28.65 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4310  carbonic anhydrase  28.65 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000873696  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0303  carbonate dehydratase  31.28 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.525447  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  30.41 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  30.41 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  30.29 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2454  carbonic anhydrase  42.48 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  30.53 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  32.85 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  27.36 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  31.98 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  30.23 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  30 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1943  carbonate dehydratase  32.3 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  30.41 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  29.32 
 
 
768 aa  65.1  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  29.32 
 
 
768 aa  65.1  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  27.69 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  28.95 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3684  carbonic anhydrase  30.59 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000316532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  29.63 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  31.76 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  30.29 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4062  carbonic anhydrase  35.56 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  28.57 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1417  carbonate dehydratase  27.04 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  30.41 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  30.41 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  29.82 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  30.26 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2488  carbonic anhydrase  33.59 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000357075  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  31.61 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1737  carbonic anhydrase  29.53 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  29.17 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  29.82 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0217  carbonic anhydrase  28.8 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0194382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2939  carbonic anhydrase  34.31 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10436e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  30.77 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  26.55 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  29.25 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  28.49 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  29.61 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3841  carbonate dehydratase  29.84 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  29.47 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  28.41 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  31.98 
 
 
235 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  28.82 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  29.17 
 
 
201 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  28.87 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4087  carbonic anhydrase  33.7 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00019736  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  30.53 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  39.29 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  25 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1994  carbonic anhydrase  31.95 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00658745  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0240  carbonic anhydrase  27.75 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  28.9 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  30.3 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  35.83 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  29.94 
 
 
754 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  28.12 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  30.99 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  31.4 
 
 
380 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  27.5 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0405  carbonic anhydrase  27.22 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.0139247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  30.37 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  30 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0991  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0388173  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  29 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  29.19 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1098  carbonic anhydrase  29.74 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  28.72 
 
 
264 aa  58.9  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3786  carbonic anhydrase  28.26 
 
 
248 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2100  carbonate dehydratase  29.15 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.54932  normal  0.632203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  30.68 
 
 
749 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  28.5 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  28.87 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>