40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0234 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0234  flagella protein  100 
 
 
553 aa  1029    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  67.19 
 
 
573 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2872  Flagella accessory C family protein  51.23 
 
 
811 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.899166  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2564  Flagella accessory C family protein  38.27 
 
 
620 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.840692  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2868  Flagella accessory C family protein  51.3 
 
 
482 aa  87.8  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  44.44 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0687  flagella protein  51.76 
 
 
165 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  41.03 
 
 
268 aa  67  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  32.32 
 
 
433 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  40.7 
 
 
3521 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0143  flagella protein  28.57 
 
 
348 aa  54.7  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.626308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  39.53 
 
 
3471 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  39.53 
 
 
3472 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  29.89 
 
 
1281 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  53.06 
 
 
501 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3416  Flagella accessory C family protein  36.67 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1570  flagella protein  32.31 
 
 
428 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  23.32 
 
 
444 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0642  flagella protein  33.33 
 
 
114 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  31.5 
 
 
630 aa  49.3  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0970  flagella protein  26.42 
 
 
337 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  42.25 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  39.73 
 
 
926 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0261  flagella accessory C family protein  34.43 
 
 
181 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0653102  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  36.9 
 
 
489 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  56.6 
 
 
611 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  56.6 
 
 
611 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  40.62 
 
 
3409 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  38.03 
 
 
484 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1646  hypothetical protein  46.3 
 
 
717 aa  47  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.061153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  34.78 
 
 
522 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  29.9 
 
 
772 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  39.18 
 
 
525 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  37.37 
 
 
535 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  43.84 
 
 
539 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1002  flagella protein  27.78 
 
 
321 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3849  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  51.43 
 
 
468 aa  44.3  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  32.5 
 
 
1261 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  35.48 
 
 
991 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22510  hypothetical protein  41.03 
 
 
608 aa  43.9  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.818778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>