25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2705 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 125 aa  253  9e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  66.96 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  61.95 
 
 		 127 aa  147  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  34.26 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  34.29 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  31.53 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  23.97 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  25.24 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  22.31 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  24.51 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  27.05 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  25.49 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  25.81 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0992  transcriptional regulator, TrmB  31.15 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 352 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  54.76 
 
 		 119 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 105 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>