32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1353 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  100 
 
 
247 aa  503  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  70.94 
 
 
236 aa  349  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  68.88 
 
 
240 aa  335  5.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  64.56 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  68.24 
 
 
237 aa  325  4.0000000000000003e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  63.48 
 
 
240 aa  316  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  63.25 
 
 
239 aa  315  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  65.11 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  65.96 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  63.27 
 
 
267 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  63.47 
 
 
259 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  61.92 
 
 
247 aa  295  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  64.52 
 
 
248 aa  292  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  59.49 
 
 
240 aa  284  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  62.84 
 
 
261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  59.47 
 
 
261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  58.82 
 
 
261 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  59.36 
 
 
249 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  58.92 
 
 
261 aa  278  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  63.3 
 
 
269 aa  278  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  61.93 
 
 
261 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  61.93 
 
 
261 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  61.86 
 
 
297 aa  274  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  58.37 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  54.77 
 
 
261 aa  271  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  59.46 
 
 
266 aa  270  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  58.56 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  59.28 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  56.44 
 
 
249 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  57.02 
 
 
242 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  57.33 
 
 
261 aa  251  9.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  44.34 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>