More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1336 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1336  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  100 
 
 
373 aa  771    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2469  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  77.23 
 
 
358 aa  568  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00523376  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0025  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  74.49 
 
 
349 aa  535  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1176  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  58.01 
 
 
382 aa  408  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.55 
 
 
389 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2583  respiratory nitrate reductase beta subunit  47.55 
 
 
333 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68171  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1902  4Fe-4S ferredoxin  45.34 
 
 
317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1906  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.94 
 
 
473 aa  267  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  36.7 
 
 
512 aa  266  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0498  nitrate reductase, beta subunit  37.14 
 
 
473 aa  266  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.43114  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  37.16 
 
 
512 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  36.36 
 
 
508 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  35.89 
 
 
511 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3085  nitrate reductase, beta subunit  36.16 
 
 
525 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  36.7 
 
 
513 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  35.65 
 
 
511 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  36.7 
 
 
513 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1544  nitrate reductase, beta subunit  35.41 
 
 
509 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0121  nitrate reductase, beta subunit  34.15 
 
 
509 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  35.56 
 
 
509 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  38.5 
 
 
584 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1629  nitrate reductase, beta subunit  34.15 
 
 
509 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  36.13 
 
 
543 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.49 
 
 
519 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  35.41 
 
 
511 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1955  respiratory nitrate reductase beta subuni  36.26 
 
 
512 aa  258  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.089713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  36.63 
 
 
517 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  34.67 
 
 
491 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  34.67 
 
 
491 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  37.19 
 
 
514 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  35.58 
 
 
512 aa  256  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  38.35 
 
 
588 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3139  nitrate reductase, beta subunit  36.14 
 
 
576 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250265  hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  34.67 
 
 
491 aa  255  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  34.44 
 
 
491 aa  255  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  34.67 
 
 
491 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  35.94 
 
 
512 aa  255  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0274  nitrate reductase, beta subunit  35.58 
 
 
512 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4477  nitrate reductase, beta subunit  37.12 
 
 
526 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.619422  normal  0.432155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5212  nitrate reductase subunit beta  35.42 
 
 
560 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  0.717062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.67 
 
 
527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  35.1 
 
 
512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  32.1 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  35.78 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.05 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  35.83 
 
 
515 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5442  nitrate reductase (beta subunit)  37.34 
 
 
553 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  36.02 
 
 
509 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.99 
 
 
549 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  37.03 
 
 
505 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.02 
 
 
511 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.86 
 
 
507 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  34.63 
 
 
507 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.63 
 
 
507 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2127  nitrate reductase, beta subunit  36.02 
 
 
509 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.52 
 
 
515 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  36.12 
 
 
504 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  32.76 
 
 
510 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.49 
 
 
538 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.19 
 
 
544 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0249  nitrate reductase, beta subunit  35.56 
 
 
502 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0794164  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  34.74 
 
 
507 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  36.81 
 
 
507 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  36.36 
 
 
514 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  35.87 
 
 
509 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  37.34 
 
 
566 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  34.55 
 
 
514 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  34.55 
 
 
514 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  36.43 
 
 
514 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  36.43 
 
 
514 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2077  nitrate reductase 2, beta subunit  36.43 
 
 
514 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  36.43 
 
 
514 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  35.73 
 
 
513 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  36.43 
 
 
514 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.764488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  36.43 
 
 
514 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  36.43 
 
 
514 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  37.28 
 
 
508 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  35.5 
 
 
517 aa  249  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  36.43 
 
 
512 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1914  nitrate reductase 1, beta subunit  36.43 
 
 
512 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.288869  normal  0.118614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1377  nitrate reductase 1, beta subunit  35.77 
 
 
511 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1894  nitrate reductase 1, beta subunit  35.77 
 
 
511 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.256537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1958  nitrate reductase 1 subunit beta  35.77 
 
 
511 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  36.43 
 
 
512 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2398  nitrate reductase, beta subunit  36.43 
 
 
512 aa  248  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000272064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1393  nitrate reductase 1, beta subunit  36.43 
 
 
512 aa  248  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01213  hypothetical protein  36.43 
 
 
512 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.552443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  36.43 
 
 
512 aa  248  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1899  nitrate reductase 1, beta subunit  35.77 
 
 
511 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.404395  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  33.87 
 
 
510 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1335  nitrate reductase, beta subunit  36.43 
 
 
512 aa  248  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00571547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1376  nitrate reductase, beta subunit  36.43 
 
 
512 aa  248  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0922315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  32.68 
 
 
520 aa  248  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1560  nitrate reductase 1 subunit beta  36.18 
 
 
512 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.713297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  33.97 
 
 
519 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  36.18 
 
 
514 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  32.1 
 
 
521 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  36.18 
 
 
514 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  35.77 
 
 
489 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  36.18 
 
 
514 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>