51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1107 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1107  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 448 aa  901    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3061  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  65.77 
 
 		 447 aa  607  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.73632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  63.09 
 
 		 447 aa  592  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  64.21 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1202  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  63.53 
 
 		 447 aa  579  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0906  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60.8 
 
 		 449 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0766913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.91 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2468  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.32 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000403556  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.36 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.218824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3337  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.54 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4307  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.9 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0675  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.67 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.562473 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0982  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.08 
 
 		 445 aa  160  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.503939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17270  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 		 547 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2813  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.67 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3572  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  27.87 
 
 		 506 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0465  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.74 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267369  unclonable  0.000014976 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5256  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.07 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.85 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3025  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.36 
 
 		 532 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605449  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1510  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.08 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000184999  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3043  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.99 
 
 		 541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1968  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.18 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0344  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.63 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.828514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2241  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.98 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.93 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.37 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3443  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.93 
 
 		 537 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2286  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.24 
 
 		 685 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1125  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.79 
 
 		 562 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3268  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.42 
 
 		 602 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5113  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.72 
 
 		 545 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.271498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2285  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.32 
 
 		 724 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1628  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.48 
 
 		 590 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.77 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1166  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.23 
 
 		 542 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.22 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2343  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.32 
 
 		 628 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0220  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.78 
 
 		 533 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000131562  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.23 
 
 		 684 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2671  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 		 665 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.25 
 
 		 682 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4593  hypothetical protein  22.4 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.09 
 
 		 558 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.11 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0535  hypothetical protein  24.72 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.98 
 
 		 964 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.37 
 
 		 553 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.24 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0625  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.86 
 
 		 681 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>