17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0236 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0236  protein of unknown function DUF105  100 
 
 
248 aa  480  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.926355  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2838  Adenosylcobinamide hydrolase  63.97 
 
 
255 aa  256  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0992  Adenosylcobinamide hydrolase  54.96 
 
 
288 aa  241  9e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389903  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  56.91 
 
 
243 aa  238  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  56.5 
 
 
241 aa  236  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  30.43 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  30.56 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  24 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  31.08 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  27.27 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  33.14 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  29.85 
 
 
297 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  33.64 
 
 
250 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  35.05 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  41.38 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  30.08 
 
 
494 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  32.69 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>