25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0137 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  448  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  73.16 
 
 
203 aa  279  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  66.99 
 
 
208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  66.67 
 
 
213 aa  270  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  66.15 
 
 
204 aa  256  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  55.98 
 
 
189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  54.64 
 
 
188 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  52.2 
 
 
188 aa  187  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  62.33 
 
 
520 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  49.72 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  55.86 
 
 
332 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  58 
 
 
615 aa  174  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  46.41 
 
 
197 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  56.67 
 
 
617 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  55.77 
 
 
550 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  53.18 
 
 
556 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  42.62 
 
 
201 aa  155  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  42.54 
 
 
191 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  45.75 
 
 
287 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  46.45 
 
 
289 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  36.67 
 
 
282 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  34.88 
 
 
252 aa  88.2  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  33.8 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.8 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  36.04 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>