More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2177 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2177  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
538 aa  1081    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  46.87 
 
 
548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0290  glucose-6-phosphate isomerase  49.36 
 
 
553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  45.2 
 
 
560 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 
543 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  46.06 
 
 
548 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  44.92 
 
 
649 aa  431  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  45.25 
 
 
543 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  42.8 
 
 
567 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  45.15 
 
 
541 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  43.12 
 
 
546 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  46.06 
 
 
553 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  39.42 
 
 
547 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  43.82 
 
 
547 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  46.81 
 
 
547 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  46.29 
 
 
549 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  43.16 
 
 
531 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  46.29 
 
 
549 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  46.29 
 
 
549 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  44.36 
 
 
549 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  45.78 
 
 
547 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  46.89 
 
 
550 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  45.35 
 
 
551 aa  415  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  41.71 
 
 
545 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  40.43 
 
 
550 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  42.74 
 
 
548 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  41.52 
 
 
549 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  41.56 
 
 
552 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  40.86 
 
 
552 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  45.88 
 
 
546 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  42.74 
 
 
548 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  45.69 
 
 
546 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  39.69 
 
 
548 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  44.09 
 
 
548 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2546  glucose-6-phosphate isomerase  44.25 
 
 
559 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  45.07 
 
 
545 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  42.74 
 
 
548 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  44.13 
 
 
547 aa  411  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  44.25 
 
 
541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  39.96 
 
 
549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 
545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  39.67 
 
 
554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 
549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  42.45 
 
 
562 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  41 
 
 
549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 
549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  43.36 
 
 
554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0118  glucose-6-phosphate isomerase  41.45 
 
 
555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 
549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  40.89 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  41.28 
 
 
547 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  45.01 
 
 
543 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  40.73 
 
 
550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  41.59 
 
 
545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  41.7 
 
 
549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 
549 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 
549 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  40.12 
 
 
547 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 
545 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  47.31 
 
 
540 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  42.44 
 
 
547 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 
549 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  41.64 
 
 
545 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  42.96 
 
 
565 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  39.73 
 
 
550 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  47.31 
 
 
540 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  47.31 
 
 
540 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  47.11 
 
 
615 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 
549 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  44.69 
 
 
541 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  42.35 
 
 
541 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  45.56 
 
 
554 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  41.59 
 
 
545 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 
549 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  47.31 
 
 
540 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  43.87 
 
 
554 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 
545 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  39.78 
 
 
549 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  41.34 
 
 
545 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0272  glucose-6-phosphate isomerase  43.24 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  42.14 
 
 
545 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  42.97 
 
 
541 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0109  glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 
555 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 
549 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  43.3 
 
 
553 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  47.11 
 
 
540 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  47.11 
 
 
540 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  46.11 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  47.11 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  43.49 
 
 
554 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  41.4 
 
 
545 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 
549 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  39.82 
 
 
549 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  43.49 
 
 
554 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  45.91 
 
 
540 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  43.84 
 
 
541 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  40.22 
 
 
559 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  39.41 
 
 
549 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>