More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0109 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0109  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 555 aa  1154    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0272  glucose-6-phosphate isomerase  66.79 
 
 		 563 aa  756    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0118  glucose-6-phosphate isomerase  93.87 
 
 		 555 aa  1092    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2546  glucose-6-phosphate isomerase  55.47 
 
 		 559 aa  596  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0608  glucose-6-phosphate isomerase  50.83 
 
 		 543 aa  547  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.028095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  44.92 
 
 		 547 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 547 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  44.55 
 
 		 548 aa  487  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  44.67 
 
 		 562 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  44.79 
 
 		 548 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  44.59 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  46.1 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  44.74 
 
 		 549 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  43.83 
 
 		 567 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  44.81 
 
 		 547 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 549 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  44.97 
 
 		 549 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  44.34 
 
 		 649 aa  475  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 541 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  43.88 
 
 		 548 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  42.57 
 
 		 546 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  43.05 
 
 		 548 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 547 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  43.64 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 545 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  44.46 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  44.34 
 
 		 559 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  43.73 
 
 		 545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  44.06 
 
 		 543 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  45.28 
 
 		 549 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  43.77 
 
 		 549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  44.46 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  43.96 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  44.27 
 
 		 545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  44.87 
 
 		 554 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 554 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  44.34 
 
 		 543 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  45.03 
 
 		 550 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  44.19 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  44.61 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  42.65 
 
 		 545 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  45.11 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  45.23 
 
 		 561 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  45.9 
 
 		 548 aa  467  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  44.08 
 
 		 545 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  43.3 
 
 		 545 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  43.59 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  43.59 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  44.87 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  42.65 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  43.73 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  43.59 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1102  glucose-6-phosphate isomerase  42.5 
 
 		 547 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.400634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  43.77 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  43.77 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  43.59 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  43.59 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  44.16 
 
 		 548 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  43.51 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  43.77 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  43.51 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  44.87 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  43.59 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  43.59 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 545 aa  465  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  43.51 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  42.59 
 
 		 552 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  43.55 
 
 		 550 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 550 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0913  glucose-6 phosphate 1-epimerase  42.31 
 
 		 547 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  44.69 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  42.6 
 
 		 550 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 547 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  42.75 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1020  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 546 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  44.59 
 
 		 554 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  44.07 
 
 		 554 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  42.8 
 
 		 569 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  41.89 
 
 		 550 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 549 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  44.97 
 
 		 554 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  46.42 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  42.7 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  41.95 
 
 		 550 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  47.09 
 
 		 565 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  43.89 
 
 		 552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  43.77 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  43.77 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  44.66 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  43.99 
 
 		 547 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  42.24 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  41.84 
 
 		 549 aa  452  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  44.08 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>