More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0653 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  100 
 
 		 1098 aa  2223    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 1381 aa  1033    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  49.34 
 
 		 1272 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  62.53 
 
 		 610 aa  506  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  62.27 
 
 		 610 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1462  primary replicative DNA helicase  46.68 
 
 		 2605 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.695864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 602 aa  330  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  43.63 
 
 		 849 aa  325  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  43.35 
 
 		 593 aa  298  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  64.06 
 
 		 465 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  61.11 
 
 		 461 aa  280  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  61.97 
 
 		 461 aa  280  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  40.88 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  57.87 
 
 		 472 aa  271  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  58.37 
 
 		 462 aa  266  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  57.01 
 
 		 464 aa  263  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  57.01 
 
 		 464 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  58.72 
 
 		 464 aa  259  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  57.34 
 
 		 465 aa  258  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  42.63 
 
 		 807 aa  258  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  56.42 
 
 		 473 aa  257  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  56.42 
 
 		 463 aa  257  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  57.73 
 
 		 465 aa  257  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  57.34 
 
 		 465 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  55.96 
 
 		 462 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  55.96 
 
 		 462 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  56.88 
 
 		 464 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  56.42 
 
 		 463 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  57.01 
 
 		 463 aa  256  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  57.34 
 
 		 465 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  56.88 
 
 		 464 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  56.88 
 
 		 465 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  54.59 
 
 		 470 aa  254  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  53.46 
 
 		 468 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  55.5 
 
 		 462 aa  252  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  55.5 
 
 		 460 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  55.5 
 
 		 460 aa  249  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 461 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  55.5 
 
 		 460 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  55.5 
 
 		 460 aa  249  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  55.5 
 
 		 460 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 461 aa  249  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  64.48 
 
 		 460 aa  248  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  64.48 
 
 		 460 aa  248  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  55.5 
 
 		 460 aa  248  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 460 aa  247  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 460 aa  247  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 460 aa  247  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 460 aa  247  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 460 aa  247  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 460 aa  247  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 460 aa  247  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  55.05 
 
 		 460 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  48.77 
 
 		 879 aa  247  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 468 aa  245  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  54.21 
 
 		 472 aa  246  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 468 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  45.61 
 
 		 821 aa  245  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 468 aa  244  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  54.59 
 
 		 462 aa  244  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  50.69 
 
 		 468 aa  244  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 468 aa  244  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 468 aa  244  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  52.07 
 
 		 468 aa  244  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 468 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  53.92 
 
 		 468 aa  242  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  53.92 
 
 		 468 aa  241  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  54.42 
 
 		 473 aa  239  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  51.87 
 
 		 473 aa  238  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 467 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  52.53 
 
 		 468 aa  239  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  41.16 
 
 		 1118 aa  238  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  50.23 
 
 		 468 aa  238  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  53.27 
 
 		 468 aa  238  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  49.31 
 
 		 468 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  49.31 
 
 		 468 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  49.31 
 
 		 468 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  49.31 
 
 		 468 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  52.8 
 
 		 469 aa  238  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  53.24 
 
 		 463 aa  237  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 473 aa  237  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  53.27 
 
 		 477 aa  237  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  50.69 
 
 		 468 aa  237  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 468 aa  236  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 468 aa  236  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 451 aa  236  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  50.46 
 
 		 468 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 474 aa  236  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  53.74 
 
 		 472 aa  235  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  53.74 
 
 		 472 aa  235  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 466 aa  234  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  49.54 
 
 		 478 aa  234  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  51.63 
 
 		 471 aa  233  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  51.63 
 
 		 471 aa  233  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  51.63 
 
 		 471 aa  233  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  51.63 
 
 		 470 aa  233  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  51.63 
 
 		 471 aa  233  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  51.63 
 
 		 471 aa  233  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 466 aa  233  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  51.63 
 
 		 471 aa  233  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>