21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0421 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  1000    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  40.49 
 
 		 491 aa  309  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  37.65 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  39.83 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  39.07 
 
 		 493 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  37.89 
 
 		 486 aa  286  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  34.96 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  35.21 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  34.98 
 
 		 491 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  34.5 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  33.4 
 
 		 500 aa  237  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  31.22 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  31.71 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  27.46 
 
 		 451 aa  180  7e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  33.24 
 
 		 525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  22.73 
 
 		 714 aa  94.4  5e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  31.08 
 
 		 709 aa  94  6e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  35.25 
 
 		 663 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  25.6 
 
 		 690 aa  47.8  0.0005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  23.24 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  23.24 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>